Le variant Covid BA.5, sous-lignage d’Omicron, remplace progressivement le BA.2 en France et représente désormais 41% des tests positifs au Covid. Il est plus transmissible et échappe davantage au vaccin. Il pourrait entraîner des pertes du goût et de l’odorat.
[Mise à jour le 24 juin 2022 à 10h52] Le virus initial de la maladie Covid-19, le Sars-Cov-2, a muté plusieurs fois jusqu’au variant Omicron qui a commencé à arriver fin 2021 en France. Aujourd’hui majoritaire, ce variant a cinq sous-lignages dont le BA.5 qui se diffuse rapidement en juin en France et remplace le BA.2. « Au cours de l’enquête Flash Semaine 23 (6-12 juin), BA.2 représentait 33% des séquences interprétables et BA.5 41% alors que lors de Flash Semaine 22, les données observées indiquaient 55% pour BA.2 et 23% pour BA.5 » informe Santé Publique France dans son point épidémiologique du 23 juin. « Si on compare BA.4, BA.5 par rapport à BA.2 qui a été à l’origine d’une vague en mars, BA.2 était déjà différent du variant Omicron de décembre-janvier parce qu’il était plus transmissible. Mais il n’échappe pas plus au vaccin. Maintenant, nous avons BA.4, BA.5 qui se propagent mieux que le BA.2. Celui-là, il échappe un peu mieux au vaccin. Et ça montre la capacité évolutive du virus qui est capable d’échapper aux vaccins, en même temps qu’augmenter sa transmission. Mais on sait aussi que les symptômes ne sont pas plus sévères » a a expliqué l’infectiologue Anne-Claude Crémieux le 22 juin sur Franceinfo.. Santé Publique France souligne néanmoins que « la probabilité de présenter anosmie [perte d’odorat] et agueusie [perte du goût], mais aussi nausées, vomissements et diarrhée est plus élevée pour les cas de BA.4/BA.5 par rapport à ceux de BA.1″. C’est quoi ces nouveaux variants du Covid ? Entrainent-ils des symptômes différents ? en France, dangers… Le point.
C’est quoi le variant BA.5 ?
BA.4 et BA.5 sont des sous-lignages du variant Omicron du Covid-19. Les sous-lignages BA.4 et BA.5 ont commencé à être identifiés en janvier et février 2022 en Afrique du Sud selon l’ECDC ; début avril selon Santé Publique France. Ils se sont diffusés au Portugal, entraînant une nouvelle vague de Covid-19 en mai particulièrement virulente pour les plus de 80 ans.
Quels sont les symptômes du variant BA.5 ?
Selon Santé Publique France, les signes cliniques les plus fréquents en cas d’infection aux variants BA.4 et BA.5 sont la fatigue, la toux, la fièvre et les maux de tête. De plus, « la probabilité de présenter anosmie [perte d’odorat] et agueusie [perte du goût], mais aussi nausées, vomissements et diarrhée est plus élevée pour les cas de BA.4/BA.5″ indique l’agence de santé.

Combien de temps dure les symptômes du variant BA5 ?
La durée des signes cliniques est en moyenne de 7 jours pour les cas de BA.4 et BA.5 contre 4 jours pour les autres cas Omicron.
Quel est le taux du variant BA.5 en France ?
« En France, on observe un remplacement progressif de BA.2 par BA.5, qui représente 41% des séquences interprétables de Flash Semaine 23 (contre 24,2% pour Flash Semaine 22). La détection de BA.4 est aussi en augmentation mais à des niveaux plus faibles : 6% en semaine 23 » indique Santé Publique France le 23 juin.

Le variant BA.5 est-il plus contagieux ?
« Le BA5 est plus contagieux que le BA2. Compte tenu du fait qu’il est plus contagieux, il échappe un peu mieux à l’immunité post-vaccinal donc on va sans doute continuer de voir cette recrudescence de nouveaux cas dans les semaines qui viennent« , a expliqué Yves Buisson, président de la cellule Covid de l’Académie de Médecine sur Europe le 7 juin. Les sous-lignages d’Omicron BA.4 et BA.5 ont remplacé le BA.2 et ont entraîné une nouvelle vague épidémique en Afrique du Sud (5e vague). Même chose pour le BA.5 exclusivement au Portugal (sans impact épidémiologique majeur à ce stade).
→ En Afrique du Sud : le taux de croissance du BA.4 est +8% par jour par rapport au BA2 ; +12% pour le BA.5.
→ Au Portugal : « Au Portugal, BA.5 est aujourd’hui majoritaire, avec 69% en semaine 21.. BA.5 a été associé à une reprise épidémique dans le pays, mais le pic de cette vague débutée fin avril semble aujourd’hui passé. Si cela se confirme, l’amplitude de la vague aura été bien moindre que la précédente » indique Santé Publique France le 15 juin.
Le variant BA.5 est-il plus dangereux ?
Les données accumulées dans plusieurs pays n’ont pas observé d’augmentation de la sévérité associée à BA.4 et BA.5. Selon le dernier rapport épidémiologique de l’ECDC relaté par Santé Publique France le 15 juin, « rien n’indique actuellement un quelconque changement de gravité pour des cas infectés par BA.4 ou BA.5 par rapport aux autres sous-lignages d’Omicron ». Le taux
d’hospitalisation n’est pas significativement plus élevé pour BA.4 et BA.5 par rapport à BA.1 et la majorité des cas hospitalisés présentent des facteurs de risque. « La durée médiane d’hospitalisation (pour les cas BA4 ou BA5, ndlr) est de 5 jours » ajoute l’organisme de santé.
Quelles différences entre le variant BA.5 et le variant BA.2 ?
« BA.4, BA.5 se propagent mieux que le BA.2. Celui-là (BA5, ndlr) échappe un peu mieux au vaccin. Et ça montre la capacité évolutive du virus qui est capable d’échapper aux vaccins, en même temps qu’augmenter sa transmission. Mais on sait aussi que les symptômes ne sont pas plus sévères » a indiqué l’épidémiologiste Anne-Claude Crémieux le 22 juin sur FranceInfo. « Ces deux sous-lignages sont assez similaires à BA.2 mais leur protéine Spike possède en plus les mutations L452R/F486V et la réversion R493Q. BA.4 et BA.5 ont rapidement remplacé BA.2 en Afrique du Sud. BA.4 et BA.5 » rapportait Santé Publique France le 18 mai. La mutation L452R que l’on retrouvait aussi sur le variant Delta est à nouveau en hausse en juin dans les tests positifs au Covid. L’âge médian des cas investigués en France est de 47 ans, plus élevé que celui des cas d’infection par BA.1 (35 ans).
Sources :
– Analyse de risque sur les variants émergents du SARS-CoV-2 réalisée conjointement par Santé publique France et le CNR des virus des infections respiratoires, 15 juin 2022.
– Mise à jour épidémiologique : SARS-CoV-2 Omicron sous-lignées BA.4 et BA.5, ECDC, 13 mai 2022
– Bulletin épidémiologique, Santé Publique France